Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP107P57740 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP107P57740 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP107P57740 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP107P57740 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP107P57740 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP107P57740 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP107P57740 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP107P57740 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP107P57740 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP107P57740 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP107P57740 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP107P57740 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP107P57740 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP107P57740 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP107P57740 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP107P57740 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP107P57740 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP107P57740 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP107P57740 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP107P57740 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP107P57740 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP107P57740 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP107P57740 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP107P57740 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP107P57740 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP107P57740 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP107P57740 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP107P57740 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP107P57740 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP107P57740 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP107P57740 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP107P57740 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP107P57740 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP107P57740 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP107P57740 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP107P57740 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP107P57740 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP107P57740 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP107P57740 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP107P57740 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP107P57740 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP107P57740 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP107P57740 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP107P57740 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP107P57740 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP107P57740 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP107P57740 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP107P57740 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms