Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAPAP54920 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAPAP54920 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAPAP54920 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAPAP54920 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAPAP54920 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAPAP54920 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NAPAP54920 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAPAP54920 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAPAP54920 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAPAP54920 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAPAP54920 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAPAP54920 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAPAP54920 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAPAP54920 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAPAP54920 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAPAP54920 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NAPAP54920 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAPAP54920 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAPAP54920 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAPAP54920 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NAPAP54920 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAPAP54920 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAPAP54920 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAPAP54920 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAPAP54920 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAPAP54920 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAPAP54920 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAPAP54920 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAPAP54920 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NAPAP54920 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAPAP54920 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAPAP54920 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAPAP54920 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAPAP54920 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAPAP54920 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAPAP54920 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAPAP54920 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAPAP54920 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAPAP54920 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAPAP54920 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAPAP54920 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAPAP54920 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NAPAP54920 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAPAP54920 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAPAP54920 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NAPAP54920 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NAPAP54920 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NAPAP54920 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NAPAP54920 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAPAP54920 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAPAP54920 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAPAP54920 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NAPAP54920 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAPAP54920 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAPAP54920 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAPAP54920 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NAPAP54920 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NAPAP54920 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NAPAP54920 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NAPAP54920 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NAPAP54920 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NAPAP54920 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms