Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKN1CP49918 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKN1CP49918 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms