Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAPPC10P48553 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC10P48553 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms