Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTTP42858 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTTP42858 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTTP42858 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTTP42858 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTTP42858 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTTP42858 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTTP42858 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTTP42858 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTTP42858 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTTP42858 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTTP42858 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTTP42858 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HTTP42858 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTTP42858 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTTP42858 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTTP42858 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTTP42858 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTTP42858 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTTP42858 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTTP42858 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
HTTP42858 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTTP42858 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTTP42858 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HTTP42858 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HTTP42858 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HTTP42858 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HTTP42858 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HTTP42858 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTTP42858 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTTP42858 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HTTP42858 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTTP42858 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTTP42858 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTTP42858 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTTP42858 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTTP42858 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTTP42858 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HTTP42858 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTTP42858 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTTP42858 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HTTP42858 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTTP42858 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HTTP42858 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTTP42858 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTTP42858 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTTP42858 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTTP42858 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTTP42858 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTTP42858 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTTP42858 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HTTP42858 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTTP42858 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTTP42858 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTTP42858 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTTP42858 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HTTP42858 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HTTP42858 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTTP42858 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTTP42858 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTTP42858 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTTP42858 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTTP42858 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTTP42858 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTTP42858 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTTP42858 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTTP42858 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTTP42858 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTTP42858 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms