Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC19A1P41440 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC19A1P41440 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC19A1P41440 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms