Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAR1BP31321 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAR1BP31321 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms