Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC13P31276 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC13P31276 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC13P31276 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC13P31276 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms