Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5AP29375 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM5AP29375 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5AP29375 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5AP29375 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5AP29375 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms