Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP1P23763 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAMP1P23763 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAMP1P23763 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms