Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFE3P19532 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFE3P19532 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFE3P19532 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFE3P19532 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFE3P19532 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFE3P19532 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFE3P19532 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFE3P19532 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFE3P19532 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFE3P19532 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFE3P19532 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFE3P19532 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFE3P19532 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFE3P19532 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFE3P19532 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFE3P19532 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFE3P19532 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFE3P19532 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFE3P19532 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFE3P19532 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TFE3P19532 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFE3P19532 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFE3P19532 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFE3P19532 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFE3P19532 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFE3P19532 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFE3P19532 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFE3P19532 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFE3P19532 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFE3P19532 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFE3P19532 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFE3P19532 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TFE3P19532 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TFE3P19532 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFE3P19532 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFE3P19532 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFE3P19532 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFE3P19532 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFE3P19532 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFE3P19532 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFE3P19532 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFE3P19532 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFE3P19532 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFE3P19532 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFE3P19532 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFE3P19532 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFE3P19532 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFE3P19532 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TFE3P19532 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFE3P19532 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TFE3P19532 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TFE3P19532 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFE3P19532 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TFE3P19532 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFE3P19532 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFE3P19532 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TFE3P19532 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFE3P19532 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFE3P19532 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFE3P19532 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFE3P19532 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms