Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAM1P18669 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAM1P18669 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGAM1P18669 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGAM1P18669 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.8 ms