Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DESP17661 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DESP17661 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DESP17661 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DESP17661 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DESP17661 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DESP17661 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DESP17661 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DESP17661 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DESP17661 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DESP17661 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DESP17661 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DESP17661 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DESP17661 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DESP17661 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DESP17661 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DESP17661 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DESP17661 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DESP17661 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DESP17661 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DESP17661 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DESP17661 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DESP17661 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DESP17661 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DESP17661 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DESP17661 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DESP17661 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DESP17661 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DESP17661 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DESP17661 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DESP17661 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DESP17661 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DESP17661 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DESP17661 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DESP17661 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DESP17661 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DESP17661 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DESP17661 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DESP17661 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DESP17661 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DESP17661 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DESP17661 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DESP17661 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DESP17661 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DESP17661 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DESP17661 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms