Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPEP16870 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPEP16870 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPEP16870 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPEP16870 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPEP16870 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPEP16870 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPEP16870 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPEP16870 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPEP16870 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPEP16870 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPEP16870 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPEP16870 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEP16870 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEP16870 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEP16870 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEP16870 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEP16870 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEP16870 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEP16870 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEP16870 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEP16870 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEP16870 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEP16870 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEP16870 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEP16870 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEP16870 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEP16870 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEP16870 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEP16870 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEP16870 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEP16870 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEP16870 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEP16870 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEP16870 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEP16870 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEP16870 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEP16870 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEP16870 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEP16870 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEP16870 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPEP16870 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPEP16870 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPEP16870 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPEP16870 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPEP16870 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPEP16870 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPEP16870 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPEP16870 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPEP16870 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms