Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTHFD2P13995 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTHFD2P13995 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTHFD2P13995 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms