Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HSP90AB1P08238 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
HSP90AB1P08238 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HSP90AB1P08238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
HSP90AB1P08238 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HSP90AB1P08238 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms