Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB3P05106 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGB3P05106 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB3P05106 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms