Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF2P04141 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF2P04141 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF2P04141 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF2P04141 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF2P04141 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF2P04141 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSF2P04141 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSF2P04141 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSF2P04141 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSF2P04141 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSF2P04141 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF2P04141 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF2P04141 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF2P04141 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF2P04141 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF2P04141 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSF2P04141 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSF2P04141 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSF2P04141 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSF2P04141 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF2P04141 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF2P04141 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF2P04141 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF2P04141 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSF2P04141 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF2P04141 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF2P04141 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF2P04141 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF2P04141 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSF2P04141 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSF2P04141 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF2P04141 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSF2P04141 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF2P04141 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSF2P04141 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSF2P04141 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF2P04141 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF2P04141 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF2P04141 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSF2P04141 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF2P04141 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF2P04141 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF2P04141 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF2P04141 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSF2P04141 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF2P04141 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF2P04141 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF2P04141 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSF2P04141 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms