Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CD4P01730 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD4P01730 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD4P01730 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD4P01730 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD4P01730 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD4P01730 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD4P01730 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD4P01730 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD4P01730 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD4P01730 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD4P01730 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD4P01730 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD4P01730 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD4P01730 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD4P01730 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD4P01730 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD4P01730 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD4P01730 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD4P01730 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD4P01730 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD4P01730 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD4P01730 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD4P01730 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD4P01730 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD4P01730 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD4P01730 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD4P01730 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD4P01730 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD4P01730 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD4P01730 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD4P01730 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CD4P01730 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD4P01730 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD4P01730 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD4P01730 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD4P01730 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD4P01730 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD4P01730 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD4P01730 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD4P01730 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CD4P01730 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD4P01730 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD4P01730 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD4P01730 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD4P01730 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD4P01730 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD4P01730 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD4P01730 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD4P01730 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD4P01730 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD4P01730 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD4P01730 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD4P01730 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD4P01730 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD4P01730 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD4P01730 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD4P01730 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD4P01730 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD4P01730 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD4P01730 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD4P01730 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD4P01730 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD4P01730 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD4P01730 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD4P01730 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms