Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT4O95628 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNOT4O95628 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT4O95628 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms