Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB6O95452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB6O95452 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB6O95452 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB6O95452 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB6O95452 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB6O95452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB6O95452 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB6O95452 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB6O95452 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJB6O95452 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB6O95452 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB6O95452 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB6O95452 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB6O95452 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB6O95452 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB6O95452 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB6O95452 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB6O95452 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB6O95452 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB6O95452 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB6O95452 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB6O95452 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB6O95452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB6O95452 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB6O95452 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB6O95452 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB6O95452 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJB6O95452 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB6O95452 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB6O95452 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB6O95452 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJB6O95452 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB6O95452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB6O95452 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB6O95452 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB6O95452 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJB6O95452 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB6O95452 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB6O95452 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB6O95452 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB6O95452 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJB6O95452 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJB6O95452 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB6O95452 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB6O95452 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJB6O95452 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB6O95452 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB6O95452 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB6O95452 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB6O95452 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB6O95452 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms