Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN3O95197 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN3O95197 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN3O95197 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN3O95197 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN3O95197 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN3O95197 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN3O95197 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN3O95197 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN3O95197 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN3O95197 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN3O95197 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN3O95197 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN3O95197 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN3O95197 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN3O95197 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN3O95197 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN3O95197 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN3O95197 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN3O95197 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN3O95197 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN3O95197 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN3O95197 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTN3O95197 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTN3O95197 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN3O95197 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN3O95197 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTN3O95197 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTN3O95197 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN3O95197 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN3O95197 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN3O95197 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN3O95197 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN3O95197 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RTN3O95197 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTN3O95197 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN3O95197 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN3O95197 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN3O95197 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN3O95197 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTN3O95197 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN3O95197 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTN3O95197 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN3O95197 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN3O95197 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN3O95197 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN3O95197 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN3O95197 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN3O95197 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN3O95197 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN3O95197 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN3O95197 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN3O95197 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN3O95197 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN3O95197 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN3O95197 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN3O95197 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN3O95197 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN3O95197 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms