Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FARP2O94887 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FARP2O94887 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FARP2O94887 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FARP2O94887 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FARP2O94887 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FARP2O94887 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FARP2O94887 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP2O94887 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP2O94887 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP2O94887 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP2O94887 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FARP2O94887 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FARP2O94887 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FARP2O94887 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FARP2O94887 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FARP2O94887 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FARP2O94887 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FARP2O94887 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FARP2O94887 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FARP2O94887 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FARP2O94887 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FARP2O94887 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FARP2O94887 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FARP2O94887 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FARP2O94887 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FARP2O94887 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FARP2O94887 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FARP2O94887 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FARP2O94887 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP2O94887 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP2O94887 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP2O94887 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP2O94887 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FARP2O94887 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FARP2O94887 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FARP2O94887 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FARP2O94887 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP2O94887 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP2O94887 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP2O94887 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP2O94887 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FARP2O94887 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP2O94887 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP2O94887 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FARP2O94887 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FARP2O94887 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FARP2O94887 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP2O94887 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP2O94887 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP2O94887 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP2O94887 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FARP2O94887 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FARP2O94887 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FARP2O94887 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FARP2O94887 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FARP2O94887 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FARP2O94887 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FARP2O94887 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FARP2O94887 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FARP2O94887 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FARP2O94887 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP2O94887 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP2O94887 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP2O94887 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FARP2O94887 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FARP2O94887 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FARP2O94887 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FARP2O94887 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FARP2O94887 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FARP2O94887 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FARP2O94887 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms