Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24DO94855 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24DO94855 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms