Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM4O75871 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM4O75871 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM4O75871 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms