Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC6AO75865 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6AO75865 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6AO75865 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms