Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KERAO60938 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KERAO60938 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KERAO60938 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KERAO60938 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KERAO60938 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KERAO60938 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KERAO60938 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KERAO60938 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KERAO60938 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KERAO60938 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KERAO60938 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KERAO60938 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KERAO60938 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KERAO60938 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KERAO60938 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KERAO60938 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KERAO60938 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KERAO60938 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KERAO60938 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KERAO60938 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KERAO60938 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KERAO60938 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KERAO60938 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KERAO60938 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KERAO60938 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KERAO60938 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KERAO60938 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KERAO60938 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KERAO60938 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KERAO60938 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KERAO60938 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KERAO60938 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KERAO60938 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KERAO60938 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KERAO60938 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KERAO60938 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KERAO60938 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KERAO60938 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KERAO60938 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KERAO60938 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KERAO60938 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KERAO60938 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KERAO60938 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KERAO60938 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KERAO60938 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KERAO60938 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KERAO60938 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KERAO60938 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KERAO60938 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KERAO60938 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KERAO60938 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KERAO60938 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KERAO60938 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KERAO60938 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KERAO60938 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KERAO60938 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KERAO60938 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KERAO60938 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KERAO60938 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KERAO60938 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KERAO60938 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KERAO60938 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KERAO60938 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KERAO60938 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KERAO60938 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms