Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFB5O43674 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB5O43674 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB5O43674 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB5O43674 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms