Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC8O43402 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC8O43402 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC8O43402 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC8O43402 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC8O43402 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC8O43402 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC8O43402 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC8O43402 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC8O43402 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC8O43402 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC8O43402 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC8O43402 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC8O43402 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC8O43402 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC8O43402 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC8O43402 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC8O43402 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC8O43402 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC8O43402 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC8O43402 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC8O43402 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC8O43402 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC8O43402 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC8O43402 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC8O43402 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC8O43402 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EMC8O43402 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC8O43402 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC8O43402 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC8O43402 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC8O43402 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC8O43402 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC8O43402 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC8O43402 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC8O43402 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC8O43402 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC8O43402 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC8O43402 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC8O43402 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC8O43402 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC8O43402 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC8O43402 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC8O43402 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC8O43402 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC8O43402 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC8O43402 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC8O43402 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC8O43402 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC8O43402 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC8O43402 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC8O43402 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC8O43402 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC8O43402 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC8O43402 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC8O43402 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC8O43402 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC8O43402 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC8O43402 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC8O43402 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms