Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ST8SIA3O43173 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ST8SIA3O43173 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ST8SIA3O43173 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms