Protein–RNA interactions for Protein: O15258

RER1, Protein RER1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RER1O15258 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RER1O15258 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RER1O15258 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RER1O15258 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RER1O15258 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RER1O15258 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RER1O15258 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RER1O15258 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RER1O15258 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RER1O15258 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RER1O15258 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RER1O15258 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RER1O15258 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RER1O15258 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RER1O15258 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RER1O15258 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RER1O15258 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RER1O15258 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RER1O15258 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RER1O15258 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RER1O15258 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RER1O15258 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RER1O15258 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RER1O15258 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RER1O15258 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RER1O15258 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RER1O15258 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RER1O15258 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RER1O15258 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RER1O15258 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RER1O15258 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RER1O15258 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RER1O15258 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RER1O15258 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RER1O15258 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RER1O15258 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RER1O15258 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RER1O15258 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RER1O15258 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RER1O15258 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RER1O15258 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RER1O15258 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RER1O15258 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RER1O15258 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RER1O15258 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RER1O15258 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RER1O15258 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RER1O15258 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RER1O15258 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RER1O15258 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RER1O15258 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RER1O15258 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RER1O15258 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms