Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APAF1O14727 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APAF1O14727 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
APAF1O14727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
APAF1O14727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APAF1O14727 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
APAF1O14727 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APAF1O14727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
APAF1O14727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
APAF1O14727 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
APAF1O14727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
APAF1O14727 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APAF1O14727 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APAF1O14727 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
APAF1O14727 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
APAF1O14727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APAF1O14727 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APAF1O14727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APAF1O14727 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APAF1O14727 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
APAF1O14727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
APAF1O14727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APAF1O14727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APAF1O14727 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APAF1O14727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
APAF1O14727 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
APAF1O14727 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
APAF1O14727 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
APAF1O14727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
APAF1O14727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
APAF1O14727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
APAF1O14727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
APAF1O14727 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
APAF1O14727 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
APAF1O14727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
APAF1O14727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
APAF1O14727 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
APAF1O14727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
APAF1O14727 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
APAF1O14727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
APAF1O14727 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
APAF1O14727 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
APAF1O14727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
APAF1O14727 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
APAF1O14727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
APAF1O14727 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
APAF1O14727 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
APAF1O14727 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
APAF1O14727 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
APAF1O14727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
APAF1O14727 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
APAF1O14727 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
APAF1O14727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
APAF1O14727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
APAF1O14727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
APAF1O14727 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
APAF1O14727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
APAF1O14727 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
APAF1O14727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
APAF1O14727 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
APAF1O14727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
APAF1O14727 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
APAF1O14727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
APAF1O14727 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
APAF1O14727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
APAF1O14727 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
APAF1O14727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
APAF1O14727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
APAF1O14727 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
APAF1O14727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
APAF1O14727 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
APAF1O14727 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
APAF1O14727 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
APAF1O14727 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
APAF1O14727 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
APAF1O14727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
APAF1O14727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
APAF1O14727 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
APAF1O14727 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
APAF1O14727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
APAF1O14727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
APAF1O14727 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
APAF1O14727 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
APAF1O14727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
APAF1O14727 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
APAF1O14727 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
APAF1O14727 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
APAF1O14727 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
APAF1O14727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
APAF1O14727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
APAF1O14727 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
APAF1O14727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
APAF1O14727 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms