Protein–RNA interactions for Protein: A6NGD5

ZSCAN5C, Putative zinc finger and SCAN domain-containing protein 5C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSCAN5CA6NGD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZSCAN5CA6NGD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSCAN5CA6NGD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSCAN5CA6NGD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.6 ms