Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT87PA6NCN2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT87PA6NCN2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT87PA6NCN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms