Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP69A5D8W1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP69A5D8W1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP69A5D8W1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP69A5D8W1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.3 ms