Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSC5DA1L4H1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSC5DA1L4H1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSC5DA1L4H1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSC5DA1L4H1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms