Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYCE3A1L190 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYCE3A1L190 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYCE3A1L190 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYCE3A1L190 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCE3A1L190 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCE3A1L190 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCE3A1L190 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYCE3A1L190 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE3A1L190 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE3A1L190 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYCE3A1L190 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCE3A1L190 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE3A1L190 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE3A1L190 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE3A1L190 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE3A1L190 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCE3A1L190 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms