Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms