Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC189A1A4V9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC189A1A4V9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms