Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WUJ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WUJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A087WUJ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms