Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms