Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
V9GY48 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
V9GY48 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
V9GY48 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
V9GY48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
V9GY48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
V9GY48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GY48 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GY48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GY48 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GY48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GY48 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GY48 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GY48 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GY48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GY48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GY48 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GY48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GY48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
V9GY48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
V9GY48 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
V9GY48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
V9GY48 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
V9GY48 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
V9GY48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
V9GY48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
V9GY48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
V9GY48 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GY48 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GY48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GY48 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GY48 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GY48 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GY48 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
V9GY48 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
V9GY48 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
V9GY48 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
V9GY48 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GY48 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GY48 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GY48 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GY48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GY48 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GY48 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GY48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
V9GY48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
V9GY48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
V9GY48 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
V9GY48 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
V9GY48 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
V9GY48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
V9GY48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
V9GY48 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
V9GY48 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
V9GY48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
V9GY48 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
V9GY48 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
V9GY48 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GY48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GY48 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GY48 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GY48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GY48 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GY48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GY48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GY48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GY48 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GY48 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GY48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GY48 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GY48 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GY48 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GY48 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
V9GY48 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GY48 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GY48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GY48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GY48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
V9GY48 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
V9GY48 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms