Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQ87 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
U3KQ87 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
U3KQ87 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
U3KQ87 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
U3KQ87 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQ87 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQ87 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQ87 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U3KQ87 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U3KQ87 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U3KQ87 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U3KQ87 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQ87 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQ87 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQ87 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQ87 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQ87 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQ87 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQ87 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQ87 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQ87 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQ87 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQ87 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQ87 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQ87 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQ87 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQ87 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQ87 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQ87 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQ87 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQ87 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQ87 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQ87 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQ87 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQ87 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
U3KQ87 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQ87 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQ87 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQ87 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQ87 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQ87 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
U3KQ87 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQ87 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQ87 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQ87 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
U3KQ87 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQ87 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQ87 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQ87 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQ87 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQ87 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
U3KQ87 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQ87 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQ87 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQ87 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
U3KQ87 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms