Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNCAIPQ9Y6H5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCAIPQ9Y6H5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SNCAIPQ9Y6H5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms