Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AUP1Q9Y679 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AUP1Q9Y679 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms