Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB6Q9Y5E3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB6Q9Y5E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms