Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms