Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM50BQ9Y247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM50BQ9Y247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM50BQ9Y247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM50BQ9Y247 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms