Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOD1Q9Y239 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOD1Q9Y239 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOD1Q9Y239 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOD1Q9Y239 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms