Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS11EQ9UL52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS11EQ9UL52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS11EQ9UL52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.7 ms