Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDV3Q9UKY7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDV3Q9UKY7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDV3Q9UKY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms